中共重庆中医药学院纪律检查委员会、重庆市监委驻重庆中医药学院监察专员办公室合署办公，设立纪检监察室，下设综合科、第一纪检监察科、第二纪检监察科。协调配合学院党政检查党和国家各项方针、政策、纪律及学院各项制度的贯彻落实情况，服从服务学院改革、发展和稳定大局，保障学院中心工作的顺利进行，促进学院健康发展。制定各项纪检监察工作制度，负责信访接待及处理，组织查处各类违纪案件。